מזכיר האיגוד ייבחר על ידי הוועד ומבין חבריו ברוב קולות. מתפקידיו לדאוג לעריכת פרוטוקולים של ישיבות האיגוד והוועד, ולבצע את התכתבויות האיגוד, לדאוג לרשימה מעודכנת של החברים ופרטיהם האישיים וכתובותיהם ועליו להודיע לחברים על פגישות, אסיפות וכיו"ב. בהעדרו ימלא את מקומו יו"ר האיגוד או סגנו.