האיגוד ייוצג במוסדות של ההסתדרות הרפואית בישראל כמקובל לגבי איגודים השייכים אליה. חברי האיגוד המייצגים אותו במוסדות הנ"ל יוזמנו על ידי היו"ר להשתתף ex officio וללא זכות הצבעה בישיבות ועד האיגוד הרלוונטי לנושא המיוצג.
הנציגים חייבים להיות חברים מן המניין באיגוד. נציגים אלה יקפידו על ייצוג הולם של האינטרסים של האיגוד בהתאם למדיניות הנקבעת על ידי ועד האיגוד ובצמוד לתקנון האיגוד.